Medicinska biokemija in molekularna genetika -  IZPITNE TEME  ZA ŠTUDENTE MEDICINE

 

  1. Prenos in ohranjanje genetske infomacije -podvojevanje DNA

·         Splošne značilnosti podvojevanja DNA in vloga encimov ter drugih proteinov v tem procesu

·         Podvojevanje DNA pri prokariontih

·         Podvojevanje genomske DNA pri evkariontih

·         Podvojevanje telomernih področij DNA

·         Podvojevanje mitohondrijske DNA

·         Pomen natančnosti podvojevanja DNA

·         Popravljanje napak med replikacijo

·         Pomen razlik v podvojevanju DNA med prokarionti in evkarionti za medicino

·         Inhibitorji podvojevanja DNA in njihov pomen v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         V:  Izolacija in karakterizacija genomske DNA iz krvi
  1. Popravljanje poškodb DNA

·         Dejavniki, ki vplivajo na nastanek poškodb DNA

·         Mehanizmi in pomen popravljanja poškodb DNA

·         Posledice nefunkcionalnosti encimov, povezanih s popravljanjem poškodb DNA za človeka

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

  1. Sinteza RNA

·         Značilnosti in pomen  nukleotidnih zaporedij prokariontskih in evkariontskih DNA za sintezo RNA

·         Sinteza  RNA in vloga encimov ter drugih proteinov v tem procesu pri prokariontih in evkariontih

·         Podobnosti in razlike med sintezo RNA in podvojevanjem DNA

·         Inhibitorji sinteze RNA in pomen njihove uporabe v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Zorenje prepisov RNA

·         Sinteza  funkcionalnih mRNA

·         Sinteze funkcionalnih rRNA in tRNA ter njihov pomen za organizme

·         Sinteze funkcionalnih siRNA in miRNA ter njihov pomen za organizme

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Sinteza proteinov

·         Značilnosti genetskega koda

·         Aktivacija aminokislin in pomen natančnosti te reakcije za sintezo proteinov

·         Stopnje v sintezi citosolnih in drugih proteinov

·         Inhibitorji sinteze proteinov in pomen njihove uporabe v medicine

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Posintetska dodelava proteinov

·         Glikozilacije proteinov in njihov pomen za organizme.

·         Najpogostejše modifikacije aminokislinskih ostankov in njihov pomen za funkcionalnost proteinov.

·         Posintetski dodelavi kolagena in inzulina ter posledice nepravilnosti teh procesov za človeka .

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Uravnavanje izražanja genov

·         Mehanizmi uravnavanja izražanja genov pri prokariontih in evkariontih:

·         na ravni prepisovanja in stabilnosti RNA

·         na ko- in potranskripcijski ravni

·         na ravni sinteze proteinov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Nekateri vidiki uporabe tehnologije rekombinantne DNA v medicini

·         Restrikcijski encimi in njihova uporaba v molekularni biologiji

·         Priprava, pomnoževanje in analiza rekombinantnih molekul DNA

·         Vnos rekombinantnih molekul DNA v celice in tkiva

·         Hibridizacija nukleinskih kislin in uporaba na hibridizaciji temelječih metod za detekcijo specifičnih zaporedij DNA v medicini

·         Pomnoževanje DNA z verižno reakcijo polimeraze (PCR) in možnosti uporabe v medicini

·         Princip določanja nukleotidnega zaporedja

·         Molekularno genetski pristopi v medicinski diagnostiki in gensko zdravljenje

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         V: Navodila za vaje: Določanje delecij genov za glutation S-transferazi z metodo PCR, Analiza DNA rekombinantnega plazmidnega vektorja

·         V: Pristopi za analizo rekombinantnih plazmidnih vektorjev

·         V: Uporaba spletnih orodij za analizo proteinov in prikaz signalnih poti
  1. Molekularna genetika raka

·         Rak kot genetska bolezen

·         Molekularni mehanizmi nastanka raka

·         Molekularni mehanizmi delovanja onkogenov in tumor supresorskih genov

·         Molekularno genetske osnove tarčnega zdravljenja raka

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem

·         Značilnosti in pomen katabolizma in anabolizma

·         Načini in pomen aktivacije substratov v metabolizmu

·         Pomen koencimov v metabolizmu

·         Ravni uravnavanja metabolizma

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Eksperimentalni sistemi v medicinski biokemiji

·         V: Navodila za vaje: Eksperimentalne metode za študij metabolizma.
  1. Prenos signala in uravnavanje metaboličnih procesov

·         Signalne molekule in njihova vloga v uravnavanju izražanja genov in metaboličnih procesov

·         Hormoni kot signalne molekule in njihovi receptorji

·         Mehanizmi prenosa signala, posredovanega s hormoni, ki uravnavajo metabolizem

·         Ključne kinaze, ki so vključene v prenos signala

·         Pomen  MAP-kinaznih poti v uravnavanju izražanja genov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Vloga AMPK

·         V: Uporaba spletnih orodij za analizo proteinov in prikaz signalnih poti
  1. Biokemični vidiki delovanja nekaterih hormonov

 

·         Hormoni hipotalamusa - biosinteza, sproščanje in mehanizem delovanja

·         Hormoni hipofize, biosinteza, sproščanje in mehanizem delovanja

·         Hormoni ščitnice in obščitnice: T3 in T4, parat hormon, biosinteza, mehanizem delovanja

·         Pankreatični hormoni: inzulin, glukagon- biosinteza, mehanizem delovanja,

·         Hormoni sredice nadledvične žleze:adrenalin- biosinteza, mehanizem delovanja,

·         Hormoni steroidogenih tkiv: gluko in mineralo-kortikoidi in spolni hormoni - biosinteza, mehanizem delovanja

·         Adipokini in njihova vloga v metabolizmu

·         Hormoni prebavnega trakta in njihova vloga v metabolizmu

·         Eikozanoidi: biosinteza in mehanizem delovanja

·         Inaktivacija  hormonov 

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 

 
  1. Oksidacija goriv in nastanek ATP

·         Metabolična goriva in pridobivanje ATP

·         Pomen kisika za oksidacijo goriv

·         Izvor in vloga acetil-CoA v metabolizmu

·         Citratni cikel (produkti, uravnavanje, amfibolna vloga)

·         Prenos elektronov v dihalni verigi in oksidativna fosforilacija

·         Inhibitorji dihalne verige in oksidativne fosforilacije

·         Delovanje odklopnikov in ionoforov ter posledice za organizem

·         Ostali procesi za nastanek ATP (fosforilacija na ravni substrata, nastanek ATP s pomočjo kreatin- kinaze in adenilat-kinaze)

·         Oksidacije, ki niso povezane z dihalno verigo

·         Encimi družine citokrom P-450 in njihov pomen za organizem

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 
  1. Toksični produkti kisika in dušika

·         Nastanek reaktivnih kisikovih spojin (ROS) in reaktivnih dušikovih spojin (RNS)

·         Vloga kovinskih ionov pri nastanku ROS

·         Lastnosti ROS in RNS

·         Poškodbe, ki jih povzročajo ROS ter RNS na biomolekulah

·         Obramba pred ROS in RNS

·         ROS in RNS v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: ROS in lipidi  

·         V: Določanje aktivnosti antioksidativnih encimov in peroksidacije lipidov v hemolizatu eritrocitov
  1. Pridobivanje metaboličnih goriv iz prehrane

 

·         Pomen prebave za organizem

·         Prebavni encimi, njihove lastnosti in vloga v prebavi

·         Spodbujanje prebave in prebavni hormoni

·         Proencimske oblike prebavnih encimov in njihova aktivacija

·         Produkti prebave in njihova absorpcija v enterocite

·         Prenos produktov prebave do tkiv

·         Okvare encimov, povezanih s prebavo hranil

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Viri ogljikovih hidratov (OH)  in njihova prebava

·         Eksogeni viri glukoze

·         Encimi, ki sodelujejo pri prebavi ogljikovih hidratov

·         Produkti prebave ogljikovih hidratov in njihova absorpcija

·         Motnje v delovanju encimov in transporterjev vključenih prebavo OH

 

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prebava ogljikovih hidratov

·         V: Prebava OH
  1. Glukoza kot poglavitno metabolično gorivo- razgradnja glukoze

 

 

 

·        Vloga heksokinaze/glukokinaze

·        Shematični pregled aerobne razgradnje glukoze do CO2 in H2O

·        Glikoliza kot vir piruvata

·        Anaerobna glikoliza in njen pomen

·        Uravnavanje aerobne razgradnje glukoze

·        Uravnavanje anaerobne glikolize

·        Okvare encimov, povezanih s procesom  razgradnje glukoze

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Glukokinaza in homeostaza glukoze
  1. Glukoneogeneza
  • Glukoneogeneze in njen pomen za homeostazo glukoze v krvi
  • Substrati za glukoneogenezo
  • Laktatni (Corijev) in glukoza-alaninski cikel
  • Uravnavanje glukoneogeneze
  • Okvare encimov, povezanih s procesom glukoneogeneze
  • Razgradnja etanola in njen vpliv na glukoneogenezo
  • Predavanje
  • U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem glikogena
  • Glikogen kot endogeni vir glukoze
  • Razgradnja glikogena in  uravnavanje
  • Biosinteza glikogena in uravnavanje
  • Pomen zalog glikogena v jetrih in v mišicah
  • Predavanje
  • U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  • V: Kvantitativno določanje glikogena v tkivih
  1. Metabolizem drugih monosaharidov in disaharidov

 

·         Vstop fruktoze in galaktoze v glikolizo

·         Okvare encimov, povezanih z metabolizmom

fruktoze in galaktoze

·         Biosinteza laktoze in njeno uravnavanje

·         Biosinteza glukuronske kisline

·         Pomen vezave glukuronske kisline v detoksifikaciji endogenih in eksogenih substratov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1.  Fosfoglukonatna pot

 

·         Oksidativna in neoksidativna veja poti

·         Ključni produkti poti

·         Pomen fosfoglukonatne poti

·         Okvare encimov povezanih s fosfoglukonatno potjo

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Viri maščob in njihova prebava

·         Eksogeni  viri maščobnih kislin

·         Lipidi v hrani

·         Encimi, ki sodelujejo pri prebavi lipidov

·         Žolčne kisline in njihov pomen za prebavo in absorpcijo lipidov

·         Produkti prebave lipidov

·         Absorpcija produktov v enterocite in sinteza hilomikronov

·         Prenos produktov prebave lipidov po telesu

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prebava lipidov

·         V: Prebava lipidov.
  1. TAG kot vir energije

·         Lastnosti in pomen zalog triacilglicerolov za organizem

·         Razgradnja endogenih maščob  in njeno uravnavanje

·         Lastnosti in pomen lipaz

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Maščobne kisline (MK) kot  vir energije – oksidativna razgradnja MK

·         Shematični pregled oksidacije MK  do CO2 in H2O

·         b-oksidacije MK

·         Produkti procesa b-oksidacije

·         Uravnavanje procesa b-oksidacije

·         Okvare encimov, povezanih z b-oksidacijo

·         Druge poti razgradnje maščobnih kislin

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Ketonske spojine kot metabolično gorivo

·         Shematični pregled biosinteze  ketonskih spojin v jetrih

·         Uravnavanje biosinteze ketonskih spojin

·         Aktivacija ketonskih spojin v perifernih tkivih in njihova razgradnja

·         Pomen  ketonskih spojin pri posebnih stanjih organizma

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Biosinteza maščobnih kislin

·         Encimi v  biosintezi maščobnih kislin

·         Uravnavanje biosinteze maščobnih kislin

·         Podaljševanje verige maščobnih kislin in uvajanje dvojnih vezi

·          Primerjava procesov b-oksidacije in biosinteze maščobnih kislin

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem triacilglicerolov

·         Biosinteza triacilglicerolov

·         Uravnavanje metabolizma TAG

·         Okvare encimov, povezanih z metabolizmom TAG

·         Gliceroneogeneza kot vir glicerol-3-fosfata

·         Primerjava biosinteze TAG v jetrih in maščevju

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem sestavljenih lipidov

·         Biosinteza in razgradnja fosfolipidov

·         Biosinteze in razgradnje glikolipidov

·         Okvare encimov, povezanih z razgradnjo sestavljenih lipidov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem holesterola

·         Pomen holesterola za organizem

·         Viri holesterola pri človeku

·         Shematični pregled biosinteze holesterola in drugih izoprenoidov

·         Inhibitorji biosinteze holesterola in njihov pomen v medicini

·         Biosinteza žolčnih kislin

·         Izločanje žolčnih kislin in enterohepatična cirkulacija

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem lipoproteinov

·         Pomen hilomikronov in VLDL v prenosu ekso-in endogenih TAG

·         Pomen LDL v prenosu holesterola

·         Pomen HDL v obratnem prenosu holesterola

·         Pomen apolipoproteinov v metabolizmu lipoproteinov

·         Receptorji, prenašalci in encimi v metabolizmu lipoproteinov

·         Okvare v metabolizmu lipoproteinov 

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         V: Uporaba spletnih podatkovnih zbirk za prikaz lipoproteinov in njihove presnove
  1. Metabolizem eikozanoidov

·         Pomen polinenasičenih maščobnih kislin v metabolizmu eikozanoidov

·         Shematičen pregled metabolizma prostaglandinov, tromboksanov, levkotrienov in drugih eikozanoidov

·         Uravnavanje metabolizma eikozanoidov

·         Inhibitorji  biosinteze eikozanoidov in njihov pomen v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Proteini iz hrane in njihova prebava

·         Proteini v hrani

·         Encimi v prebavi proteinov in njihova aktivacija

·         Produkti prebave proteinov in njihova absorpcija

·         Uravnavanje prebave proteinov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prebava proteinov.

·         V: Prebava proteinov.
  1. Metabolizem endogenih proteinov

·         Metabolično obračanje proteinov

·         Razgradnja  endogenih proteinov

·         Okvare proteinov, ki so vključeni  v  procese  razgradnje endogenih  proteinov - pomen v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem aminokislin

·         Poti odstranjevanja dušika iz aminokislin

·         Pomen reakcij transaminacije in oksidativne deaminacije za razgradnjo aminokislin

·         Toksičnost amonijaka

·         Pomen alanina in glutamina za  netoksičen prenos  amonijaka po krvi

·         Cikel sečnine –viri dušika za sintezo sečnine

·         Uravnavanje sinteze sečnine

·         Okvare encimov  cikla  sečnine

·         Shematičen pregled razgradnje ogljikovega skeleta posameznih aminokislin

·         Okvare encimov za  razgradnjo aminokislin

·         Shematičen pregled biosintez  neesencialnih aminokislin

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Metabolizem glutamata in glutamina

·         V: Določanje aktivnosti alanin transaminaze v bioloških vzorcih

  1. Aminokisline kot izhodne spojine za biosinteze

·         Biosinteza in vloga  glutationa

·         Biosinteza hema,  uravnavanje in inhibicija

·         Bilirubin kot razgradni produkt hema in njegovo izločanje iz organizma

·         Biosinteza in vloga  biogenih aminov.

·         Tirozin v biosintezi  ščitničnih hormonov T3 in T4

·         Tirozin v biosintezi kateholaminov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem nukleotidov

·         Izhodne spojine za biosintezo purinskih in pirimidinskih nukleotidov

·         Shematični pregled biosinteze ribonukleotidov

·         Pomen PRPP v   biosintezi ribonukleotidov de novo  in v reciklažni poti

·         Biosinteza deoksiribonukleotidov

·         Shematični pregled razgradnje ribonukleotidov in deoksiribonukleotidov

·         Uravnavanje metabolizma nukleotidov

·         Okvare encimov, povezanih z metabolizmom nukleotidov

·         Inhibitorji sinteze deoksiribonukleotidov in njihov pomen v medicine

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolične značilnosti nekaterih tkiv in organov

·         Vloga jeter in maščevja pri  razpoložljivosti  goriv

·         Vloga jeter v homeostazi glukoze in holesterola

·         Vloga jeter v detoksifikacijah (alkohol, ksenobiotiki, endogeni dušik, bilirubin)

·         Metabolične posebnosti skeletne in srčne mišice

·         Metabolične posebnosti  ostalih tkiv: eritrociti, ledvica, kosti, možgani

·         Metabolične značilnosti rakavih celic

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: ABC Transporterji
  1. Integracija metabolizma

·         Metabolični procesi po hranjenju in med obroki

·         Metabolični procesi pri podaljšanem stradanju

·         Metabolični procesi pri prekomernem hranjenju

·         Metabolični procesi pri telesni aktivnosti

 

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 

ŠTUDIJSKA LITERATURA:

o    Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 (U)

o    Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, novejše izdaje (U)

o    Navodila za vaje iz Medicinske biokemije in molekularne genetike 2017 (V)

o    Predpisani seminarji za študijsko leto 2017/2018 (S)

 

Medicinska biokemija in molekularna genetika -  IZPITNE TEME  ZA ŠTUDENTE DENTALNE MEDICINE

 

  1. Prenos in ohranjanje genetske infomacije -podvojevanje DNA

·         Splošne značilnosti podvojevanja DNA in vloga encimov ter drugih proteinov v tem procesu

·         Podvojevanje DNA pri prokariontih

·         Podvojevanje genomske DNA pri evkariontih

·         Podvojevanje telomernih področij DNA

·         Podvojevanje mitohondrijske DNA

·         Pomen natančnosti podvojevanja DNA

·         Popravljanje napak med replikacijo

·         Pomen razlik v podvojevanju DNA med prokarionti in evkarionti za medicino

·         Inhibitorji podvojevanja DNA in njihov pomen v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         V: Navodila za vaje: Izolacija in karakterizacija genomske DNA iz krvi

 
  1. Popravljanje poškodb DNA

·         Dejavniki, ki vplivajo na nastanek poškodb DNA

·         Mehanizmi in pomen popravljanja poškodb DNA

·         Posledice nefunkcionalnosti encimov, povezanih s popravljanjem poškodb DNA za človeka

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

  1. Sinteza RNA

·         Značilnosti in pomen  nukleotidnih zaporedij prokariontskih in evkariontskih DNA za sintezo RNA

·         Sinteza  RNA in vloga encimov ter drugih proteinov v tem procesu pri prokariontih in evkariontih

·         Podobnosti in razlike med sintezo RNA in podvojevanjem DNA

·         Inhibitorji sinteze RNA in pomen njihove uporabe v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 
  1. Zorenje prepisov RNA

·         Sinteza  funkcionalnih mRNA

·         Sinteze funkcionalnih rRNA in tRNA ter njihov pomen za organizme

·         Sinteze funkcionalnih siRNA in miRNA ter njihov pomen za organizme

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Sinteza proteinov

·         Značilnosti genetskega koda

·         Aktivacija aminokislin in pomen natančnosti te reakcije za sintezo proteinov

·         Stopnje v sintezi citosolnih in drugih proteinov

·         Inhibitorji sinteze proteinov in pomen njihove uporabe v medicine

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Posintetska dodelava proteinov

·         Glikozilacije proteinov in njihov pomen za organizme.

·         Najpogostejše modifikacije aminokislinskih ostankov in njihov pomen za funkcionalnost proteinov.

·         Posintetski dodelavi kolagena in inzulina ter posledice nepravilnosti teh procesov za človeka .

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Uravnavanje izražanja genov

·         Mehanizmi uravnavanja izražanja genov pri prokariontih in evkariontih:

·         na ravni prepisovanja in stabilnosti RNA

·         na ko- in potranskripcijski ravni

·         na ravni sinteze proteinov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Nekateri vidiki uporabe tehnologije rekombinantne DNA v medicini

·         Restrikcijski encimi in njihova uporaba v molekularni biologiji

·         Priprava, pomnoževanje in analiza rekombinantnih molekul DNA

·         Vnos rekombinantnih molekul DNA v celice in tkiva

·         Hibridizacija nukleinskih kislin in uporaba na hibridizaciji temelječih metod za detekcijo specifičnih zaporedij DNA v medicini

·         Pomnoževanje DNA z verižno reakcijo polimeraze (PCR) in možnosti uporabe v medicini

·         Princip določanja nukleotidnega zaporedja

·         Molekularno genetski pristopi v medicinski diagnostiki in gensko zdravljenje

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         V: Navodila za vaje: Določanje delecij genov za glutation S-transferazi z metodo PCR, Analiza DNA rekombinantnega plazmidnega vektorja

·         S: Molekularna analiza nukleinskih kislin
  1. Molekularna genetika raka

·         Rak kot genetska bolezen

·         Molekularni mehanizmi nastanka raka

·         Molekularni mehanizmi delovanja onkogenov in tumor supresorskih genov

·         Molekularno genetske osnove tarčnega zdravljenja raka

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem

·         Značilnosti in pomen katabolizma in anabolizma

·         Načini in pomen aktivacije substratov v metabolizmu

·         Pomen koencimov v metabolizmu

·         Ravni uravnavanja metabolizma

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Eksperimentalni sistemi v medicinski biokemiji

·         V: Navodila za vaje: Eksperimentalne metode za študij metabolizma.
  1. Prenos signala in uravnavanje metaboličnih procesov

·         Signalne molekule in njihova vloga v uravnavanju izražanja genov in metaboličnih procesov

·         Hormoni kot signalne molekule in njihovi receptorji

·         Mehanizmi prenosa signala, posredovanega s hormoni, ki uravnavajo metabolizem

·         Ključne kinaze, ki so vključene v prenos signala

·         Pomen  MAP-kinaznih poti v uravnavanju izražanja genov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prenos signala
  1. Biokemični vidiki delovanja nekaterih hormonov

 

·         Hormoni hipotalamusa - biosinteza, sproščanje in mehanizem delovanja

·         Hormoni hipofize, biosinteza, sproščanje in mehanizem delovanja

·         Hormoni ščitnice in obščitnice: T3 in T4, parat hormon, biosinteza, mehanizem delovanja

·         Pankreatični hormoni: inzulin, glukagon- biosinteza, mehanizem delovanja,

·         Hormoni sredice nadledvične žleze:adrenalin- biosinteza, mehanizem delovanja,

·         Hormoni steroidogenih tkiv: gluko in mineralo-kortikoidi in spolni hormoni - biosinteza, mehanizem delovanja

·         Adipokini in njihova vloga v metabolizmu

·         Hormoni prebavnega trakta in njihova vloga v metabolizmu

·         Eikozanoidi: biosinteza in mehanizem delovanja

·         Inaktivacija  hormonov 

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 

 
  1. Oksidacija goriv in nastanek ATP

·         Metabolična goriva in pridobivanje ATP

·         Pomen kisika za oksidacijo goriv

·         Izvor in vloga acetil-CoA v metabolizmu

·         Citratni cikel (produkti, uravnavanje, amfibolna vloga)

·         Prenos elektronov v dihalni verigi in oksidativna fosforilacija

·         Inhibitorji dihalne verige in oksidativne fosforilacije

·         Delovanje odklopnikov in ionoforov ter posledice za organizem

·         Ostali procesi za nastanek ATP (fosforilacija na ravni substrata, nastanek ATP s pomočjo kreatin- kinaze in adenilat-kinaze)

·         Oksidacije, ki niso povezane z dihalno verigo

·         Encimi družine citokrom P-450 in njihov pomen za organizem

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 
  1. Toksični produkti kisika in dušika

·         Nastanek reaktivnih kisikovih spojin (ROS) in reaktivnih dušikovih spojin (RNS)

·         Vloga kovinskih ionov pri nastanku ROS

·         Lastnosti ROS in RNS

·         Poškodbe, ki jih povzročajo ROS ter RNS na biomolekulah

·         Obramba pred ROS in RNS

·         ROS in RNS v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         V: Navodila za vaje: Določanje aktivnosti antioksidativnih encimov in peroksidacije lipidov v hemolizatu eritrocitov
  1. Pridobivanje metaboličnih goriv iz prehrane

 

·         Pomen prebave za organizem

·         Prebavni encimi, njihove lastnosti in vloga v prebavi

·         Spodbujanje prebave in prebavni hormoni

·         Proencimske oblike prebavnih encimov in njihova aktivacija

·         Produkti prebave in njihova absorpcija v enterocite

·         Prenos produktov prebave do tkiv

·         Okvare encimov, povezanih s prebavo hranil

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 
  1. Viri ogljikovih hidratov (OH)  in njihova prebava

·         Eksogeni viri glukoze

·         Encimi, ki sodelujejo pri prebavi ogljikovih hidratov

·         Produkti prebave ogljikovih hidratov in njihova absorpcija

·         Motnje v delovanju encimov in transporterjev vključenih prebavo OH

 

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prebava ogljikovih hidratov

·         V: Navodila za vaje: Prebava OH
  1. Glukoza kot poglavitno metabolično gorivo- razgradnja glukoze

 

 

 

·        Vloga heksokinaze/glukokinaze

·        Shematični pregled aerobne razgradnje glukoze do CO2 in H2O

·        Glikoliza kot vir piruvata

·        Anaerobna glikoliza in njen pomen

·        Uravnavanje aerobne razgradnje glukoze

·        Uravnavanje anaerobne glikolize

·        Okvare encimov, povezanih s procesom  razgradnje glukoze

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Glukokinaza in homeostaza glukoze
  1. Glukoneogeneza
  • Glukoneogeneze in njen pomen za homeostazo glukoze v krvi
  • Substrati za glukoneogenezo
  • Laktatni (Corijev) in glukoza-alaninski cikel
  • Uravnavanje glukoneogeneze
  • Okvare encimov, povezanih s procesom glukoneogeneze
  • Razgradnja etanola in njen vpliv na glukoneogenezo
  • Predavanje
  • U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 
  1. Metabolizem glikogena
  • Glikogen kot endogeni vir glukoze
  • Razgradnja glikogena in  uravnavanje
  • Biosinteza glikogena in uravnavanje
  • Pomen zalog glikogena v jetrih in v mišicah
  • Predavanje
  • U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  • V: Navodila za vaje: Kvantitativno določanje glikogena v tkivih
  1. Metabolizem drugih monosaharidov in disaharidov

 

·         Vstop fruktoze in galaktoze v glikolizo

·         Okvare encimov, povezanih z metabolizmom

fruktoze in galaktoze

·         Biosinteza laktoze in njeno uravnavanje

·         Biosinteza glukuronske kisline

·         Pomen vezave glukuronske kisline v detoksifikaciji endogenih in eksogenih substratov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1.  Fosfoglukonatna pot

 

·         Oksidativna in neoksidativna veja poti

·         Ključni produkti poti

·         Pomen fosfoglukonatne poti

·         Okvare encimov povezanih s fosfoglukonatno potjo

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Viri maščob in njihova prebava

·         Eksogeni  viri maščobnih kislin

·         Lipidi v hrani

·         Encimi, ki sodelujejo pri prebavi lipidov

·         Žolčne kisline in njihov pomen za prebavo in absorpcijo lipidov

·         Produkti prebave lipidov

·         Absorpcija produktov v enterocite in sinteza hilomikronov

·         Prenos produktov prebave lipidov po telesu

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prebava lipidov

·         V: Navodila za vaje: Prebava lipidov.
  1. TAG kot vir energije

·         Lastnosti in pomen zalog triacilglicerolov za organizem

·         Razgradnja endogenih maščob  in njeno uravnavanje

·         Lastnosti in pomen lipaz

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Maščobne kisline (MK) kot  vir energije – oksidativna razgradnja MK

·         Shematični pregled oksidacije MK  do CO2 in H2O

·         b-oksidacije MK

·         Produkti procesa b-oksidacije

·         Uravnavanje procesa b-oksidacije

·         Okvare encimov, povezanih z b-oksidacijo

·         Druge poti razgradnje maščobnih kislin

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Ketonske spojine kot metabolično gorivo

·         Shematični pregled biosinteze  ketonskih spojin v jetrih

·         Uravnavanje biosinteze ketonskih spojin

·         Aktivacija ketonskih spojin v perifernih tkivih in njihova razgradnja

·         Pomen  ketonskih spojin pri posebnih stanjih organizma

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Biosinteza maščobnih kislin

·         Encimi v  biosintezi maščobnih kislin

·         Uravnavanje biosinteze maščobnih kislin

·         Podaljševanje verige maščobnih kislin in uvajanje dvojnih vezi

·          Primerjava procesov b-oksidacije in biosinteze maščobnih kislin

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem triacilglicerolov

·         Biosinteza triacilglicerolov

·         Uravnavanje metabolizma TAG

·         Okvare encimov, povezanih z metabolizmom TAG

·         Gliceroneogeneza kot vir glicerol-3-fosfata

·         Primerjava biosinteze TAG v jetrih in maščevju

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem sestavljenih lipidov

·         Biosinteza in razgradnja fosfolipidov

·         Biosinteze in razgradnje glikolipidov

·         Okvare encimov, povezanih z razgradnjo sestavljenih lipidov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem holesterola

·         Pomen holesterola za organizem

·         Viri holesterola pri človeku

·         Shematični pregled biosinteze holesterola in drugih izoprenoidov

·         Inhibitorji biosinteze holesterola in njihov pomen v medicini

·         Biosinteza žolčnih kislin

·         Izločanje žolčnih kislin in enterohepatična cirkulacija

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem lipoproteinov

·         Pomen hilomikronov in VLDL v prenosu ekso-in endogenih TAG

·         Pomen LDL v prenosu holesterola

·         Pomen HDL v obratnem prenosu holesterola

·         Pomen apolipoproteinov v metabolizmu lipoproteinov

·         Receptorji, prenašalci in encimi v metabolizmu lipoproteinov

·         Okvare v metabolizmu lipoproteinov  

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S:Lipoproteini
  1. Metabolizem eikozanoidov

·         Pomen polinenasičenih maščobnih kislin v metabolizmu eikozanoidov

·         Shematičen pregled metabolizma prostaglandinov, tromboksanov, levkotrienov in drugih eikozanoidov

·         Uravnavanje metabolizma eikozanoidov

·         Inhibitorji  biosinteze eikozanoidov in njihov pomen v medicini

·         Predavanje

·         S: Inhibicija ciklooksigenaz

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Proteini iz hrane in njihova prebava

·         Proteini v hrani

·         Encimi v prebavi proteinov in njihova aktivacija

·         Produkti prebave proteinov in njihova absorpcija

·         Uravnavanje prebave proteinov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Prebava proteinov.

·         V: Navodila za vaje: Prebava proteinov.
  1. Metabolizem endogenih proteinov

·         Metabolično obračanje proteinov

·         Razgradnja  endogenih proteinov

·         Okvare proteinov, ki so vključeni  v  procese  razgradnje endogenih  proteinov - pomen v medicini

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem aminokislin

·         Poti odstranjevanja dušika iz aminokislin

·         Pomen reakcij transaminacije in oksidativne deaminacije za razgradnjo aminokislin

·         Toksičnost amonijaka

·         Pomen alanina in glutamina za  netoksičen prenos  amonijaka po krvi

·         Cikel sečnine –viri dušika za sintezo sečnine

·         Uravnavanje sinteze sečnine

·         Okvare encimov  cikla  sečnine

·         Shematičen pregled razgradnje ogljikovega skeleta posameznih aminokislin

·         Okvare encimov za  razgradnjo aminokislin

·         Shematičen pregled biosintez  neesencialnih aminokislin

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

·         S: Metabolizem glutamata in glutamina

·         S: Folati

  1. Aminokisline kot izhodne spojine za biosinteze

·         Biosinteza in vloga  glutationa

·         Biosinteza hema,  uravnavanje in inhibicija

·         Bilirubin kot razgradni produkt hema in njegovo izločanje iz organizma

·         Biosinteza in vloga  biogenih aminov.

·         Tirozin v biosintezi  ščitničnih hormonov T3 in T4

·         Tirozin v biosintezi kateholaminov

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011
  1. Metabolizem nukleotidov

·         Izhodne spojine za biosintezo purinskih in pirimidinskih nukleotidov

·         Shematični pregled biosinteze ribonukleotidov

·         Pomen PRPP v   biosintezi ribonukleotidov de novo  in v reciklažni poti

·         Biosinteza deoksiribonukleotidov

·         Shematični pregled razgradnje ribonukleotidov in deoksiribonukleotidov

·         Uravnavanje metabolizma nukleotidov

·         Okvare encimov, povezanih z metabolizmom nukleotidov

·         Inhibitorji sinteze deoksiribonukleotidov in njihov pomen v medicine

·         Predavanje

·         U: Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013 ali  Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 2011

 

ŠTUDIJSKA LITERATURA DM:

Predmet: Medicinska biokemija in molekularna genetika

·         Marks DB in sod., Basic Medical Biochemistry, A Clinical Approach, 2013

·         Devlin TM, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, novejše izdaje

·         Navodila za vaje iz Medicinske biokemije in molekularne genetike 2017

·         Predpisani seminarji za študijsko leto 2017/2018

 

 

Predmet: Oralna biologija- Biokemija ustne votline

·         Črešnar B., Plemenitaš A., Zorko M. in Žakelj-Mavrič M.:  Biokemija ustne votline. Skripta, 2011